特战司令部直接听命于总统或国防部长，有权自主选定猎杀目标，名单长于中情局的追杀名单。一些人指认，这类猎杀任务等同于暗杀，违反美国法律。

乔治·W·布什任总统期间，特战司令部执行任务前很少向国会通报；任务完成后，国会通常也一无所知。政府方面的律师们称，特战司令部执行的任务属于“传统军事行动”，无需事先告知国会。现任总统贝拉克·奥巴马持相同观点，但要求特战司令部就敏感任务向少数国会议员介绍情况。

2003年，拉姆斯菲尔德签署命令，授权特战司令部在伊拉克和阿富汗打击“基地”组织时可以先斩后奏；在阿尔及利亚、伊朗、马来西亚、马里、尼日利亚、巴基斯坦、菲律宾、索马里和叙利亚执行致人于死命的任务时，需要得到上级批准或这些国家政府默许。

特战司令部执行追杀和情报搜集任务，有自己的情报部队、无人驾驶飞机和侦察机、专用卫星和网络战人员。

“我们能做一些中情局做不到的事，因为他们规模不够或没有授权，”一名特战司令部人员说。

2003年秋，斯坦利·麦克里斯特尔出任特战司令部司令，加强情报收集和共享，向在华盛顿的所有国家安全机构派遣高级军官，部署100人到世界各地，搜集情报。这些人每4个月轮换一次，返回部队，确保作战能力不至生疏。