经过多轮谈判，1月21日，我党终和傅作义达成《关于和平解放北平问题的协议》。1月31日，解放军开进北平。文化古城幸免于战火。1月22日下午6时30分，阎又文宣布北平和平协议及傅作义文告。

北平解放后，中央社会部指示阎又文继续留在傅作义身边。

《李克农》(1996年)中的《平津战役》一章提及阎又文：“李克农领导的情报人员准确掌握傅作义的作战部署、政治动向及思想情绪等，及时向中央和平津前线司令部报告，为和平解放北平作出了重要贡献。”

西柏坡“国家安全教育馆”这样介绍阎又文的重要贡献：“平津战役期间，阎又文根据上级指示提供了大量关于华北‘剿总’的情报，使党中央准确掌握了傅作义情况，为制定北平和平解放方针奠定了基础。天津战役后，他及时掌握并上报傅作义的思想动态，积极施加影响，为最终促成傅作义起义、北平和平解放作出了突出贡献。”

就“继续留在傅作义身边工作”，有关部门的内部出版物《无名丰碑》作了较为清晰的解读：“北平解放后，按照中央安排，不公开阎又文真实身份，继续在傅作义身边工作”、“新中国成立后，傅作义任水利部长，调阎又文任水利部局长。因革命工作需要，阎又文一直保持着双重身份。解放前，他名为国民党高级军官，实为党的情工人员；解放后，他名为国民党起义将领，实为党的统战工作者。”

1961年，阎又文调农业部。

1962年9月25日，阎又文因患食道癌去世，年仅48岁，葬于八宝山革命公墓。阎又文临终前嘱咐妻子丁宴秋“有事情找组织”。周恩来敬赠挽联“阎又文委员千古”、薄一波的挽联是“阎又文同志千古”。《人民日报》发表简短讣告。

农业部撰写碑文：“阎又文同志曾任全国政协委员、农业部粮油生产局局长，中国共产党党员……过去曾为革命做过许多工作。”阎又文周围墓碑碑文皆有参加革命时间，入党时间，而独他是空白。对碑文措辞及空白，当年阎又文子女尚都年少，按他们的说法是“不懂”。而今真相大白后，面对如此碑文，他们提出修正意愿。目的是为了还历史以真相并对历史持有细致的尊重。