据《联合报》27日报道，在“自由行”之余，马英九还忙着展开一系列的“电话外交”，以求修补受损的台美经贸关系。据报道，马英九与美国众议院议长佩洛西等12位来自农业州的参众两院议员通话，强调台湾进口美国带骨牛肉的诚意。此外，马英九也积极向美方表示希望能购买F-16C/D型战斗机的要求，并获得美方议员支持。26日中午，马英九还和美国华人精英组织“百人会”举行餐叙，并就两岸关系发展等问题阐述台当局的政策主张。

对于马英九能在美首度“自由行”，有岛内舆论认为，尽管“牛肉危机”引发美方强烈反弹，但美方也认识到，台当局对于“立法院”的动作无可作为，且在此问题上面临尴尬处境，事后马英九更积极向美进行说明，显示马当局维护台美关系的决心与努力。美方若因此在马英九“过境”问题上再做限制，不免让外界有小觑之心。另一方面，马英九上台后一改过去陈水扁大搞“过境外交”的做法，几次“过境”都非常低调，行程保密到家，美方也愿意对马英九有所“礼遇”，以显示美方对台当局处理台美关系“奖罚分明”的态度。

此外，马英九上台后两岸关系持续缓和，也使得美方在处理马英九“过境”问题上压力大减，美方乐得做“顺水人情”，减少对马英九的部分限制。