另外，在车船税的定性和功能预设问题上，还有一个方面的内容不容忽视，即如何把它放到我国整体税制改革的大环境中进行设计，做到科学合理，既应征尽征又不重复征收。比如，就车船征税，我国目前已有购置税、燃油税，现在又有了车船税，今后或许很快会出台环境税。我们没有忘记，在论证燃油税时，职能部门也以节能减排、减少污染为主要理由，而现在论证车船税时又拿出了同样的理由，试想将来论证环境税时再拿出什么样的理由呢？如果三税都对车船排污征税，是否涉嫌重复征税呢？而要避免重复征税嫌疑，在出台环境税时是否应相应减少燃油税和车船税呢？

健全完善的税收法律制度，应以科学合理的税收种类及与国民承受能力相适应的税收负担为基础，而税收种类的科学合理则要求准确定位各税种的性质和功能，整体设计，系统改革，切实做到不漏征不重征。