截止11月23日，福建累计1843例甲型H1N1流感确诊病例，已治愈1549例，294例在接受治疗，累计重症病例5例。

11月23日至29日，9个设区市报告甲流确诊病例613例，住院治疗126例，其中重症病例15例。

11月30日至12月7日8时，9个设区市报告甲流确诊病例516例，住院治疗145例，重症病例30例，死亡3例(福州、三明、南平各报告1例)。

12月7日至13日，9个设区市报告新增甲型H1N1流感确诊病例601例，住院治疗187例，重症病例71例，死亡2例。新增聚集性疫情38起，其中学校37起，医院1起。

12月14至21日，9个设区市报告新增甲流确诊病例527例，住院治疗178例，重症病例64例，死亡3例（福建医科大学附属第一医院、厦门市中山医院、莆田市第一医院各报告1例）。

12月21日12时至27日，福建9个设区市报告新增甲型H1N1流感确诊病例410例，住院治疗124例，重症病例65例，死亡2例，其中莆田学院附属医院、福鼎市医院各报告1例。

2009年12月28日至2010年1月3日，全省9个设区市报告新增甲型H1N1流感确诊病例327例，住院治疗151例，重症病例62例，死亡3例（福州肺科医院、罗源县医院、泉州市第一医院各报告1例）。

1月3日至1月10日，全省9个设区市报告新增甲型H1N1流感确诊病例230例，住院治疗112例，重症病例38例，死亡3例（泉州、莆田、南平市各报告1例）。

截止12月27日福建累计报告新增甲流确诊病例5067例，重症病例350例，死亡16例。