１９３５年８月，他回到祖国后，正值日本侵略军制造分离中国的华北事变。他积极参加抗日救亡运动，在上海创办《大众生活》周刊，响应共产党的号召，旗帜鲜明地支持“一二九”学生爱国运动。期间，他担任上海各界救国会与全国各界救国联合会的领导工作。他的活动遭到国民党当局的忌恨，他创办的《大众生活》和《永生》杂志先后遭查禁被迫停刊。

１９３６年１１月２２日，他因积极宣传抗日，与沈钧儒等７人被国民党当局逮捕，成为著名的救国会七君子之一。１９３７年全国抗战爆发后获释，在上海创办《抗战》三日刊。上海沦陷后，转至武汉，继续主编《抗战》，并将其改编为《全民抗战》三日刊。武汉沦陷后，到重庆继续主编《全民抗战》。１９３８年任第一届国民参政会参政员。

抗日战争进入相持阶段后，国民党当局加紧迫害民主进步人士，更加严厉限制人民的言论、出版、集会、结社等各项民主权利。积极进行抗日宣传的生活书店及其出版物不断遭到查禁、封闭。１９４１年皖南事变后，邹韬奋被迫再次避走香港。在香港，他继续宣传抗日，揭露国民党当局对日妥协投降倾向和对民主进步人士的迫害。香港沦陷以后，他在中国共产党帮助下，先后转移到广东东江游击区和苏北敌后抗日根据地，继续从事抗日民主的文化宣传工作。期间，他多次向党组织提出入党请求，党组织认为他以民主人士的身份在国统区工作对党和革命事业更为有利。

１９４４年７月２４日，邹韬奋在上海病逝。临终前，他再次表达了加入中国共产党的愿望。９月２８日，中共中央根据他生前愿望追认他为中国共产党正式党员。中共中央在致其家属的唁电中称他为“吾党的光荣”，“韬奋先生二十余年为救国运动，为民主政治，为文化事业，奋斗不息，虽坐监流亡，决不屈于强暴，决不改变主张，直至最后一息，犹殷殷以祖国人民为念，其精神将长在人间，其著作将永垂不朽。”